к ДНК-штрихкоды растений - «Академкнига»

В.С. Шнеер, А.В. Родионов
ДНК-штрихкоды растений


Поиск универсального ДНК-штрихкода растений оказался очень сложной задачей. Одного участка (или комбинации из нескольких), по которому можно было бы определить  конкретный вид, не найдено. Хотя обычно комбинация, рекомендованная в 2009 г. как стандарт (rbcL + matK+ITS), позволяет отнести вид к соответствующему роду. Вариабельность отдельных маркеров не одинакова в разных таксономических группах, что, как правило, позволяет подобрать ДНК-штрихкод (иногда даже укороченный мини-штрихкод) для конкретной группы, особенно в случае задач прикладного характера. Методы секвенирования нового поколения (NGS) дают перспективу массового получения протяженных ДНК-штрихкодов (последовательностей полных хлоропластных геномов и рибосомных генов), позволяющих преодолеть ограничения стандартных ДНК-штрихкодов. Очень важно, что NGS существенно повышает возможность использования гербарных образцов. Поиски ДНК-штрихкодов для растений продолжаются.
Ключевые слова: ДНК-штрихкодирование растений, детерминация видов, хлоропластная ДНК, секвенирование нового поколения.