Н. В. Гордеева, Е. А. Салменкова
Генетические маркеры адаптивных процессов у дальневосточной горбуши Oncorhynchus gorbuscha: аллельное разнообразие в локусе главного комплекса гистосовместимости МНС I-А1

Рубрика: Генетика
Журнал: Генетика Том: 53 Номер: 11 Год: 2017

Для уточнения аллельного разнообразия в локусе главного комплекса гистосовместимости МНС класса I-А1 у дальневосточной горбуши Oncorhynchus gorbuscha проведено секвенирование выделенных из геля электрофоретических аллелей (DGGE-аллели). У 47 особей, генотипы которых состояли из десяти DGGE-аллелей, было найдено 18 нуклеотидных последовательностей МНС I-А1 и, таким образом, идентифицировано восемь критических аллелей, не выявляемых с помощью электрофореза. Одиннадцать аллелей были отмечены ранее у горбуши Хоккайдо, Аляски и Британской Колумбии, а семь, возможно, являются уникальными для популяций отдельных регионов Дальнего Востока. Шести из определенных ранее DGGE-аллелей соответствовало более одной нуклеотидной последовательности; впрочем, относимые к одному DGGE-аллелю последовательности различались в среднем менее, чем на 1 нуклеотид. Это свидетельствует о достаточной чувствительности метода DGGE, хотя полученные с его помощью оценки генетического разнообразия и дифференциации будут, очевидно, несколько занижены. Значительное преобладание несинонимичных замен над синонимичными в кодонах антиген-связывающего участка МНС  I-А1 подтверждает наличие положительного отбора, направленного на обеспечение резистентности популяций к локальному спектру патогенов. Уточнение аллельного состава адаптивно значимого генетического маркера МНС будет способствовать более полному представлению об адаптивной генетической структуре горбуши как важного элемента общей популяционной структуры вида.
Ключевые слова: горбуша Oncorhynchus gorbuscha, главный комплекс гистосовместимости, МНС I-A1, движущий отбор, адаптивная генетическая структура.